Биореактивы

Родамин 6G (R6G) - ксантеновый краситель родаминового ряда. Эмиссия R6G смещена в красную область по сравнению с флуоресцеином. Он, как и флуоресцеин, обладает высоким квантовым выходом эмиссии. Это производное R6G содержит терминальный алкиновый фрагмент для конъюгации с азидами в присутствии катализаторов на основе меди (I).

Талидомид-содержащий билдинг-блок с PEG2-линкером и азидной группой для конъюгации с алкин-функционализированными линкерами и лигандами целевых белков посредством клик-химических реакций. Комбинированные молекулы выборочного протеолиза белка (PROteolysis TArgeting Chimeras, PROTACs) — это гетеробифункциональные молекулы, способные проникать через клеточную мембрану, и позволяющие удалять выбранный целевой белок из клетки. Один конец молекулы PROTAC содержит лиганд, способный связываться с белком интереса, а второй — с субтрат-распознающим белком белкового комплекса E3-лигазы. Сближение белка и E3-лигазы вызывает полиубиквитинирование субстрата с последующей его деградацией клеточной протеасомой, которая распознает убиквитиновую метку. Существует несколько Е3-лигазных комплексов, которые на практике подходят для PROTAC. Талидомид — лиганд, который позволяет мобилизовать цереблон E3-лигазу (CRBN). Его используют многие новые исследовательские препараты работающие по механизму PROTAC, находящиеся на последних стадиях клинических испытаний.

Cyanine3B — цианиновый краситель с желтой эмиссией, являющийся улучшенной версией флуорофора Cyanine3, обладающий значительно более высокими квантовым выходом флуоресценции и фотостабильностью. Cyanine3B карбоновая кислота — это форма Cyanine3B, которую можно использовать в качестве референсного стандарта в экспериментах, где используются конъюгаты данного флуорофора. Cyanine3B карбоновую кислоту также можно использовать для синтеза активированных сложных эфиров, или модифицировать гидразинами, гидроксиламинами и аминами для последующей конъюгации с биомолекулами.

Cyanine7.5 - краситель для ближней ИК-области с большими длинами волн поглощения и эмиссии. Данный продукт - активированный эфир красителя Cyanine7.5, подходящий для мечения аминогрупп в белках, пептидах и других молекулах. Излучение ближнего ИК-диапазона легко проникает через биологические ткани благодаря наличию "инфракрасного окна" - области от 650 до 1350 нм, в которой отсутствует поглощение природных биомолекул. Поэтому инфракрасные флуорофоры позволяют проводить неинвазивную визуализацию распределения меченых белков и других молекул в живом организме. По спектральным свойствам Cyanine7.5 напоминает краситель ICG (индоцианин зеленый, indocyanine green), но имеет увеличенный квантовый выход флуоресценции благодаря особенностям химической структуры. Для мечения белков этим красителем мы рекомендуем воспользоваться нашим протоколом.

VIC — несимметричный ксантеновый краситель (два боковых кольца содержат различные заместители). Этот краситель используется для мечения зондов ПЦР реального времени. По спектральным свойствам VIC похож на HEX и JOE. Этот фосфорамидитный реагент позволяет вводить метку по 5’-положению олигонуклеотида.

Алкин-ПЭГ3-йодид (Йодо-ПЭГ3-алкин) — гидрофильный бифункциональный линкер для алкилирования нуклеофильных групп и медь-катализируемой клик-реакции. По сравнению с другими галогенидами — хлоридами и бромидами, йодиды обладают наибольшей реакционной способностью в реакциях алкилирования.

sulfo-Cyanine3 диметил — нефункционализированный водорастворимый цианиновый краситель с яркой желтой флуоресценцией. Краситель можно использовать в качестве нереактивного флуорофора для контрольных экспериментов, калибровки и других технических применений.

Бифункциональный реагент, содержащий алкиновую и гидразидную группу. Позволяет присоединять терминальную алкинильную группу путем модификации карбонильной группы альдегидов и кетонов. Карбонильные группы встречаются в белках, подвергавшихся окислительному стрессу. Многие малые молекулы, встречающиеся в природе, также являются карбонильными соединениями. Большинство сахаридов, а также РНК, содержат 1,2-диольные фрагменты, которые можно окислить периодатом до альдегидов, вступающих в реакцию с гидразидами.

Тиазоловый оранжевый (ТО) представляет собой асимметричный цианиновый краситель, флуоресценция которого сильно зависит от его ближнего окружения. ТО практически не светится в растворе, однако тысячекратно усиливает свою флуоресценцию при его введении в двухцепочечные ДНК и РНК. При гибридизации олигонуклеотида, меченного ТО, с комплементарной ему последовательностью, хромофор красителя интеркалирует в образующийся двухцепочечный фрагмент нуклеиновой кислоты. Флуоресценция ТО индуцируется как при взаимодействии с супрамолекулярными объектами, так и при взаимодействии с боковыми цепями аминокислот, что позволяет использовать его для обнаружения не только нуклеиновых кислот и белков, но и других аналитов, таких как ионы и небольшие молекулы. Максимум поглощения ТО с ДНК — 509 нм, максимум излучения — 532 нм. Активированный эфир ТО вступает в реакцию с аминами и хорошо подходит для мечения биомолекул (пептидов, белков, амино-ДНК и др.) в водной среде. ТО активированный эфир может быть полезен для изучения связывания нуклеиновых кислот с другими биомолекулами, например, ДНК-связывающими белками.

Референсный краситель для ПЦР реального времени (реалтайм-ПЦР). Рекомендуется использовать этот реагент для нормализации интенсивности флуоресценции зондов и интеркалирующих красителей типа dsGreen. Реагент содержит 25 μM родамина 101 в 10 мМ Tris-HCl (pH 8.6), 0.1 мМ EDTA и 0.01% Tween®-20. Референсный краситель ROX совместим со всеми амплификаторами, имеющими канал ROX. Большинство приборов рассчитаны на конечную концентрацию ROX от 50 до 500 нМ.

sulfo-Cyanine5.5 - это флуорофор, краситель дальнего красного спектра. Он содержит 4 сульфогруппы, которые введены в состав для повышения гидрофильности и растворимости в воде. Реагент можно конъюгировать с большим числом азидов с использованием реакций клик-химии, катализируемых медью. Его аналогом является sulfo-Cy5.5 алкин, несульфированным аналогом Сy5.5 алкин

Описание: SE-буфер ROSE+ – это модифицированный универсальный буфер ROSE (Reaction Original SibEnzyme), специально разработанный для эндонуклеаз рестрикции, требующих добавления BSA для достижения 100% активности. Концентрация BSA в 1X SE-буфере ROSE+ составляет 100 мкг/мл. Подавляющее большинство эндонуклеаз рестрикции проявляют в нем 50-100% активности. Может применяться для Turbo эндонуклеаз рестрикции и реакции с двумя ферментами одновременно (double digestion). Не рекомендуется использовать данный буфер для длительной инкубации (16 ч) с ферментами, обладающими звёздчатой активностью. Состав: Условия хранения: Хранить при -20°C. Допускается хранение буфера при 4-10°C в течение 3 месяцев. Примечание: Буфер поставляется в концентрации 10Х. В нем присутствует концентрированный BSA, поэтому этот буфер требует бережной разморозки. Мы рекомендуем размораживать SE-буфер ROSE+ (10Х) при комнатной температуре и аккуратно перемешать его перед использованием. В случае нагревания концентрированного буфера до температуры, превышающей 37°C, может образовываться осадок вследствие частичной денатурации BSA.