Поиск

G-квадруплексы (G4s) представляют собой вторичные структуры, образующиеся в ДНК и РНК за счет неканонических водородных связей между четырьмя гуаниновыми основаниями [1,2]. В ядре ДНК G4s связаны с эпигенетической регуляцией экспрессии генов посредством их взаимодействия с регуляторными белками, такими как транскрипционные факторы и модификаторы хроматина [3,4]. РНК G4s связаны со сплайсингом, транспортом и регуляцией трансляции РНК, а также с РНК-опосредованными стрессовыми реакциями в цитоплазме клетки [5-7]. TOR-G4 — производное тиазолового оранжевого, недавно синтезированный флуоресцентный индикатор G4s [8]. TOR-G4 является низкомолекулярной альтернативой иммунохимии со специфичными к G4 антителами. TOR-G4 позволяет визуализировать G4s на основе изменений продолжительности флуоресценции индикатора при связывании им нуклеиновой кислоты. Продолжительность флуоресценции TOR-G4 самая высокая в присутствии G4s и значительно ниже с другими последовательностями. Внутри клеток TOR-G4 преимущественно колокализуется с РНК в цитоплазме и ядрышках, что делает его первым прижизненным зондом, валидированным для изучения роли РНК G4s в функционировании клеток. TOR-G4 подходит для визуализации РНК G4s с помощью FLIM [8].

BDP 564/570 — липофильный краситель с эмиссией в оранжевой области. Подходит для мечения различных молекул с первичными и вторичными аминогруппами, в том числе, олигонуклеотидов с амино-модификациями.

D,L-Arginine-2,3,3-d3 hydrochloride is a stable isotope-labeled derivative of an amino acid L-arginine. D,L-Arginine-d3 is intended for use as an internal standard for the quantification of L-arginine by Tandem mass spectrometry (MS-MS) combined with UPLC, HPLC or GC.

TAMRA (тетраметилродамин) - это хорошо известный флуорофор с длинной историей использования в мечении биомолекул. TAMRA может применяться как FRET-акцептор для FAM (флуоресцеин). TAMRA амин (TMR амин) это производное с первичной аминогруппой, которую можно вводить в конъюгацию с различными электрофильными агентами, в частности, активированными эфирами, эпоксидами, а также использовать в реакциях восстановительного аминирования, в ферментативном трансаминировании.

ROX (родамин X или родамин 101) — флуорофор красной области спектра, обладающий высокой яркостью и квантовым выходом флуоресценции. Данный реагент представляет собой высокоочищенный 6-изомер. ROX карбоновая кислота представляет собой нереактивную форму красителя ROX, которую можно использовать в качестве эталонного стандарта в экспериментах с конъюгатами ROX. Кроме того, карбоксильная группа может реагировать с гидразинами, гидроксиламинами и аминами с использованием карбодиимидов, таких как EDAC.

BDP 650/665 — это бордипиррометеновый краситель с высоким квантовым выходом и эмиссией в дальней красной области спектра, он является альтернативой красителю Cyanine5 и совместим с каналом Cy5. Данное производное флуорофора BDP 650/665 хорошо подходит для окрашивания липидов и липофильных соединений.

Cyanine7.5 является флуоресцентным красителем, излучающим в ближней ИК-области. Реагент содержит аминогруппу, которую можно конъюгировать с электрофильными реагентами (например, с активированными эфирами).

Малеимид Cyanine5 - производное красителя, способное реагировать с тиолами (например, с остатками цистеина в белках и пептидах) с образованием конъюгатов. Молекула содержит одну реакционноспособную группу. Это производное имеет малую растворимость в воде, по причине чего мечение биомолекул необходимо проводить в водно-органических смесях (содержащих 10-20% диметилформамида или ДМСО). Для мечения антител и белков, плохо совместимых с органическими растворителями, мы рекомендуем воспользоваться водорастворимым малеимидом sulfo-Cyanine5, не требующим добавления органического растворителя. Cyanine5 - аналог красителя Cy5®, широко используемого флуорофора, совместимого с рядом разнообразного оборудования, такого как флуоресцентные микроскопы, системы имэджинга и планшетными сканерами флуоресценции.

Тетраметилродамин (TAMRA) - ксантеновый краситель с эмиссией в оранжевой области. Этот краситель является FRET-акцептором для флуоресцеина (FAM) и иногда используется как тушитель для него. TAMRA, как и другие ксантены, существует в виде двух изомеров (5- и 6-), обладающих очень близкими спектральными свойствами. Этот азид - производное 6-TAMRA. Его можно конъюгировать с терминальными алкинами с помощью медь-катализируемой реакции клик-химии (CuААЦ) , а также с напряженными циклоалкинами (например, циклооктинами) по реакции стерически промотируемого алкин-азидного циклоприсоединения (СПААЦ).

Носители на основе стекол контролируемой пористости (controlled pore glass, CPG) применяются для синтеза олигонуклеотидов, содержащих 3'-концевые модификации. Этот реагент предназначен для синтеза олигонуклеотидов с 3'-концевой флуоресцеиновой (FAM) меткой. Содержит чистый 6-изомер флуоресцеина. Структура этого реагента основана на энантиомерно чистом гидроксипролиноле. Этот носитель обеспечивает оптимальный выход олигонуклеотидов длиной до 60 нт. Для более длинных олигонуклеотидов рекомендуется использовать носитель CPG 1000. Реагент совместим со стандартными условиями отщепления и деблокирования для природных олигонуклеотидов (водный аммиак).

Бифункциональный ПЭГ4 кросс-линкер с терминальными алкинильной и алкилиодидной группами. Алкил-иодиды являются одними из самых мощных алкилирующих агентов, они способны реагировать с различными O-, S-, N- и С-нуклеофилами. Подобные производные могут быть использованы для получения молекул с терминальными алкинильными группами. Терминальный алкин – универсальный синтон для реакции Соногаширы или клик-химии.

Стрептавидин представляет собой тетрамерный биотин-связывающий белок, выделенный из бактерии Streptomyces avidinii. Стрептавидин способен с высокой аффинностью и селективностью связывать до четырех молекул биотина посредством множественных водородных связей и ван-дер-ваальсовых взаимодействий. Из-за отсутствия углеводных модификаций и близкого к нейтральному pI, стрептавидин демонстрирует меньшее неспецифическое связывание, в сравнении с другим биотин-связывающим белком — авидином. Стрептавидин обладает высокой термостабильностью и устойчивостью к экстремальным значениям pH, денатурирующим агентам и ферментативной деградации, что позволяет использовать его в широком спектре экспериментальных условий. Флуоресцентные конъюгаты стрептавидина обычно используют в качестве реагента второй ступени для специфического обнаружения различных биотин-меченых биомолекул, таких как белки (антитела и др.), нуклеиновые кислоты, липиды в протоколах непрямого иммунофлуоресцентного окрашивания, вестерн-блоттинге, проточной цитометрии, микропланшетном анализе и других методах детекции. Данный стрептавидин представлен в форме лиофилизированного конъюгата с AMCA — одним из самых ярких синих флуорофоров. Рекомендуемый диапазон концентраций для использования составляет 0,5-10 мкг/мл. Избегайте использования растворов, содержащих биотин (некоторые сыворотки, RPMI 1640 и т. д.) в качестве разбавителей.