Поиск

Линкеры на основе полиэтиленгликоля идеально подходят для конъюгации различных чувствительных биомолекул, таких как белки. Такие линкеры обладают гидрофильностью и обеспечивают пространственное разделение субъединиц конъюгата. Линкер на основе ПЭГ4 имеет длину 14Å (1.4 нм). Гетеробифункциональные линкеры, несущие различные функциональные группы, позволяют селективно получать конъюгаты двух различных молекул путем последовательных реакций конъюгации. Малеимидная функциональная группа особенно полезна для синтеза конъюгатов белков. Малеимид селективно реагирует с тиолами. Как правило, в белках небольшое число остатков цистеина, что позволяет проводить эту реакцию сайт-специфически. После этого алкиновая группа линкера может быть конъюгирована с азидами в реакции CuAAC (медь-катализируемая реакция алкин-азидного циклоприсоединения).

DiO, также называемый DiOC18(3), представляет собой зеленый флуоресцентный липофильный карбоцианиновый краситель. Максимум возбуждения DiO составляет 487 нм, а максимум эмиссии — 501 нм. DiO широко используется в качестве антероградного и ретроградного нейротрейсера в живых и фиксированных тканях и клетках. DiO равномерно метит нейроны посредством диффузии в плазматической мембране. В интактной ткани краситель не переходит из меченых клеток в немеченые, однако, такой перенос может наблюдаться при повреждения мембран, например, после секционирования ткани. DiO и DiI часто используются вместе в двухцветных исследованиях. При этом DiO имеет более медленную скорость боковой диффузии в мембранах, чем DiI.

Амидит для синтеза олигонуклеотидов, содержащих 5'-терминальную алкиновую модификацию. Данные олигонуклеотиды могут быть конъюгированы с различными азидами по реакции Click Chemistry с использованием нашего рекомендованного протокола. Этот амидит имеет ряд преимуществ перед фосфорамидитами на основе гексинола и бутинола. Во-первых, он твердый, что облегчает его фасовку и взвешивание. Во-вторых, благодаря особенностям его структуры, он лучше хранится и имеет большую стабильность в растворе. Для использования в олигонуклеотидном синтезаторе этот амидит следует растворять в ацетонитриле. Время конденсации рекомендуется увеличить до 5 минут. Поскольку амидит не имеет 5'-концевой диметокситритильной группы, снятие защиты после последнего шага синтеза следует опустить. Олигонуклеотиды можно деблокировать в стандартных условиях, очищать методом электрофореза в ПААГ или ионообменной хроматографией.

Активированный эфир гексиновой кислоты для модификации биомолекул. Терминальные алкинильные (ацетиленовые) группы, вступающие в реакцию медь(I)-катализируемого диполярного циклоприсоединения с азидами, практически не встречаются в природных молекулах. Этот активированный эфир позволяет присоединять алкинильные фрагменты к аминогруппам, повсеместно встречающимся в природе в составе белков, пептидов, многочисленных малых молекул, а также вводимые синтетически в амино-ДНК. Алкинильные группы могут быть затем вовлечены в клик-реакцию, катализируемую соединениями меди (I). Данный реагент - производное гексиновой кислоты.

Данный носитель предназначен для автоматизированного синтеза олигонуклеотидов с 3’-терминальной модификацией тушителем DusQ 2. Размер пор носителя 500 Å рекомендуется для синтеза олигонуклеотидов длиной до 50 оснований. DusQ 2 — тушитель флуоресценции с поглощением в диапазоне 560–670 нм. Подходит для эффективного тушения по механизму FRET флуорофоров с эмиссией в указанном диапазоне. Кроме этого, тушитель используется в гибридизационных зондах на основе статического и смешанного тушения, при этом эффективность тушения в незначительной степени зависит от перекрытия спектров флуорофора и тушителя, что обеспечивает эффективное тушение широкого спектра флуорофоров, в том числе с эмиссией в красном и дальнем красном диапазонах. Таким образом, список флуорофоров для использования с DusQ 2 включает, но не ограничивается Cyanine3, TAMRA, ROX, Cyanine3.5, Quasar® 570, Pulsar® 650, Cyanine5, Quasar® 670, Cyanine5.5, Quasar® 705.

BDP FL L-цистин представляет собой симметричный дисульфид для обратимого тиол-специфического мечения тиолированных олигонуклеотидов, белков и клеток. BDP FL L-цистин состоит из двух молекул BDP FL, соединенных между собой посредством дисульфидного мостика между двумя цистеиновыми остатками. В состоянии димерного дисульфида происходит тушение флуоресценции красителя. Дисульфидный мостик между молекулами BDP FL L-цистина очень стабилен и защищает спонтанное высвобождение тушения флуоресценции. Как и другие симметричные дисульфиды, BDP FL L-цистин вступает в реакции тиол-дисульфидного обмена. Восстановление дисульфидного мостика высвобождает мономерную молекулу красителя и приводит к возникновению флуоресценции в зеленой области спектра.

Cyanine3 - активированный эфир для двумерного электрофореза, аналог Cy3® minimal dye системы Ettan DIGE® для разностного гель-электрофореза белков в протеомике. Реагент поставляется в сухом виде в упаковках, содержащих специальным образом отмеренное количество красителя. Различие в количестве активированного эфира между фасовками составляет не более 10%. Перед использованием необходимо растворить краситель в диметилформамиде.

RAPID DiI (также известный как FAST DiI™) — карбоцианиновый краситель, флуоресцирующий в оранжево-красной части спектра, ненасыщенный аналог DiI (DiIC18(3)). RAPID DiI — липофильный краситель, который маркирует клеточные мембраны за счет встраивания двух длинных углеводородных цепей (углерод C18) в липидный бислой. Краситель слабо флуоресцирует до включения в мембраны. RAPID DiI диффундирует латерально в плазматической мембране, постепенно окрашивая всю клетку, что позволяет использовать его в качестве антероградного и ретроградного трейсера нейронов. В интактной ткани краситель не переходит из меченых клеток в немеченые, однако такой перенос может происходить при разрушении мембран клеток, например, после секционирования образца. RAPID DiI мигрирует в мембранах примерно на 50% быстрее, чем DiI. RAPID DiI можно использовать совместно с другими трейсерами в двухцветных окрашиваниях, например, с DiA и DiO. RAPID DiI представлен в виде кристаллов, которые можно наносить непосредственно на мембраны.

Производные полиэтиленгликоля с небольшим количеством звеньев (в данном случае 3 мономерных звена) являются отличными линкерами для конъюгации биомолекул, позволяя проводить реакцию в водных условиях и повышая гидрофильность полученного в результате конъюгации соединения. Терминальные алкины легко вступают в клик-реакции с различными азидами в присутствии солей меди (I), а производные малеимида реагируют с тиолами. Это особенно актуально в случае белков и пептидов, которые содержат свободные -SH группы. Алкин-ПЭГ3-малеимид представляет собой кросс-линкер с довольно широкими возможностями использования в химии, биологии и смежных областях.

BDP R6G — бордипиррометеновый краситель с длинами волн поглощения и эмиссии, соответствующими красителю родамину 6G (R6G). BDP R6G — яркий и фотостабильный флуорофор. Тетразиновый фрагмент позволяет вовлекать этот реагент в реакцию Дильса-Альдера с обращенными электронными требованиями с напряженными олефинами — транс-циклооктенами, азетинами, и другими напряженными олефинами. Эта реакция не требует использования катализаторов и протекает быстро, в том числе в водной среде.

DAF-FM диацетат (DAF-FM DA) — проникающий в клетки флуоресцентный индикатор для детекции и количественного определения низких концентраций оксида азота (NO). DAF-FM DA пассивно диффундирует через клеточные мембраны. Попав внутрь клеток, он деацетилируется внутриклеточными эстеразами и превращается в непроникающую сквозь мембраны форму — DAF-FM. Квантовый выход флуоресценции DAF-FM составляет ~ 0,005, однако он увеличивается примерно в 160 раз до ~ 0,81 после реакции с NO с образованием флуоресцентного бензотриазола (максимумы возбуждения / испускания 495/515 нм). DAF-FM более чувствителен для обнаружения NO (предел обнаружения ~3 нМ), чем DAF-2 (~5 нМ). Флуоресценция NO-аддукта DAF-FM не зависит от pH выше pH 5,5. Также NO-аддукт DAF-FM обладает большей фотостабильностью по сравнению с DAF-2 и обеспечивает более надежные результаты и дополнительное время для визуализации. Перед приготовлением рабочего раствора DAF-FM DA следует предварительно растворить в ДМСО. Буферы, содержащие бычий сывороточный альбумин (БСА) или феноловый красный, могут влиять на флуоресценцию, поэтому их следует использовать с осторожностью.

G-квадруплексы (G4s) представляют собой вторичные структуры, образующиеся в ДНК и РНК за счет неканонических водородных связей между четырьмя гуаниновыми основаниями [1,2]. В ядре ДНК G4s связаны с эпигенетической регуляцией экспрессии генов посредством их взаимодействия с регуляторными белками, такими как транскрипционные факторы и модификаторы хроматина [3,4]. РНК G4s связаны со сплайсингом, транспортом и регуляцией трансляции РНК, а также с РНК-опосредованными стрессовыми реакциями в цитоплазме клетки [5-7]. TOR-G4 — производное тиазолового оранжевого, недавно синтезированный флуоресцентный индикатор G4s [8]. TOR-G4 является низкомолекулярной альтернативой иммунохимии со специфичными к G4 антителами. TOR-G4 позволяет визуализировать G4s на основе изменений продолжительности флуоресценции индикатора при связывании им нуклеиновой кислоты. Продолжительность флуоресценции TOR-G4 самая высокая в присутствии G4s и значительно ниже с другими последовательностями. Внутри клеток TOR-G4 преимущественно колокализуется с РНК в цитоплазме и ядрышках, что делает его первым прижизненным зондом, валидированным для изучения роли РНК G4s в функционировании клеток. TOR-G4 подходит для визуализации РНК G4s с помощью FLIM [8].