Поиск

MD ДНК эндонуклеаза Kro I. Метилзависимая ДНК эндонуклеаза отличается от эндонуклеаз рестрикции тем, что режет ДНК исключительно при наличии метильных групп в сайте узнавании. При отсутствии метилирования гидролиз отсутствует. Сайт узнавания и позиция гидролиза: GC(5mC)GGC G↑C(5mC)GGC CGG(5mC)CG CGG(5mC)C↓G Источник: Kocurea rosea 307 Определение единицы активности: За одну единицу активности принимается количество фермента, необходимое дляполного гидролиза 1 мкг линейной формы плазмиды pMHpaII1/DriI за 1 час при 37°С в 50 мкл реакционной смеси. Субстрат для определения активности: Субстрат pMHpaII1/DriI представляет собой ДНК плазмиды pMHpaII1, линеаризованной эндонуклеазой рестрикции DriI. Плазмида pMHpaII1 содержит ген ДНК-метилтрасферазы M.HpaII, которая модифицирует сайт узнавания 5`-CCGG-3` с образованием 5`-C(5mC)GG-3`/3`-GG(5mC)C-5`, и три сайта узнавания KroI 5`-GC(5mC)GGC-3`/3`-CGG(5mC)CG-5`. Оптимальный буфер: SE-буфер G Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 50 100 25 50 75 100 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 200 mM NaCl; 0.1 mM EDTA; 7 mM 2-меркаптоэтанол; 50% глицерин, 200 мкг/мл BSA. Хранить при -20°С. Лигирование: Неспецифический гидролиз: Не наблюдается неспецифического гидролиза при инкубации 1 ед фермента Kro I с 1 мкг ДНК фага лямбда в течение 16 часов при 37°С в 50 мкл реакционной смеси. Чувствительность к метилированию: Фермент расщепляет только С5-метилированную ДНК. Не расщепляет немодифицированную ДНК и ДНК, метилированную MspI ДНК-метилтрансферазой. С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер G.

Сайт узнавания и позиция гидролиза: GTTAAC GTT↑AAC CAATTG CAA↓TTG Источник: Из штамма E.coli несущего клонированный ген Hpa I из Haemophilus parainfluenzae Определение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда за 1 час при 37°С в 50 мкл реакционной смеси. Субстрат для определения активности: ДНК фага лямбда Оптимальный буфер: SE-буфер Y Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 50 10 25 100 25 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 50 mM NaCl; 0.1 mM EDTA; 1 mM DTT; 200 μg/ml BSA; 50% глицерин. Хранить при -20°С. Лигирование: После гидролиза 5-кратным избытком фермента около 60% фрагментов ДНК сшиваются ДНК-лигазой и могут быть повторно расщеплены. Неспецифический гидролиз: Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 5 ед фермента в течение 16 часов при 37°С. Чувствительность к метилированию: не проверялось С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер Y. Для фасовок Turbo (E077T и E078T) прикладывается буфер Y. Примечание: Большой избыток фермента приводит к появлению звездчатой активности.

Сайт узнавания и позиция гидролиза: ACNGT ACN↑GT TGNCA TG↓NCA Источник: Bacillus stearothermophilus 4C Определение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда за 1 час при 65°С в 50 мкл реакционной смеси. Субстрат для определения активности: ДНК фага лямбда Оптимальный буфер: SE-буфер Y Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 75 75 10 25 100 50 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 200 mM NaCl; 0.1 mM EDTA; 7 mM 2-меркаптоэтанол; 200 ug/ml BSA; 50% глицерин. Хранить при -20°C. Лигирование: После гидролиза 10-кратным избытком фермента ~50% фрагментов ДНК сшиваются ДНК-лигазой. Неспецифический гидролиз: Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 20 ед фермента в течение 16 часов при 65°C. Чувствительность к метилированию: не проверялось С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер Y

Сайт узнавания: GGAT(4mC)C Источник: из штамма E.coli, содержащего клонированный ген ДНК метилтрансферазы BamHI из Bacillus amyloliquefaciens H. Описание: Модифицирует внутренний цитозин (N4) в последовательности узнавания 5’-GGATCC- 3’. Определение единицы активности: За одну единицу активности принимают количество фермента, необходимое для защиты 1 мкг ДНК фага Лямбда за 1 час при 37°C в 20 мкл реакционной смеси от гидролиза эндонуклеазой рестрикции BamHI. Реакционный буфер: SE-буфер B + SAM Условия хранения: 10 mМ Tris-HCl (pH 7.4), 50 mМ NaCl, 0.1 mМ EDTA, 1 mМ DTT, 50% глицерин. Хранить при -20°С. Примечание: Для достижения 100% активности SAM следует добавлять в реакционную смесь до концентрации 80 μM.

Сайт узнавания и позиция гидролиза: CCWGG ↑CCWGG GGWCC GGWCC↓ Источник: Pseudomonas species 6 Определение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда (dcm-) за 1 час при 55°С в 50 мкл реакционной смеси. Субстрат для определения активности: ДНК фага лямбда (dcm-) Оптимальный буфер: SE-буфер B Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 100 50 10 25 75 10 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 100 mM KCl; 0.1 mM EDTA; 200 ug/ml BSA; 7 mM2-меркаптоэтанол; 50% глицерин; Хранить при -20°С. Лигирование: После гидролиза 3-кратным избытком фермента 95% фрагментов ДНК сшиваются ДНК-лигазой и могут быть повторно расщеплены. Неспецифический гидролиз: Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 4 ед фермента в течение 16 часов при 55°С. Чувствительность к метилированию: Блокируется при перекрывании dcm-метилированием (CmCWGG) : CCWGG. С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер B. Примечание: При 37°С активность очень низкая.

Сайт узнавания и позиция гидролиза: CGGWCCG CG↑GWCCG GCCWGGC GCCWG↓GC Источник: Rhodobacter sphaeroides I2 Определение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда за 1 час при 37°С в 50 мкл реакционной смеси. Субстрат для определения активности: ДНК фага лямбда Оптимальный буфер: SE-буфер Y Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 50 75 10 100 25 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 100 mM NaCl; 0.1 mM EDTA; 100 ug/ml BSA, 7 mM 2-меркаптоэтанол; 50% глицерин; Хранить при -20°С. Лигирование: После гидролиза 20-кратным избытком фермента 90% фрагментов ДНК cшиваются ДНК-лигазой и могут быть повторно расщеплены. Неспецифический гидролиз: Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 40 ед фермента в течение 16 часов при 37°С. Чувствительность к метилированию: не проверялось С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер Y, BSA. Примечание: Для достижения 100% активности BSA следует добавлять в реакционную смесь до концентрации 100 мкг/мл. BSA при длительной инкубации использовать не рекомендуется.

Набор рассчитан на проведение 100 реакций (дополнительно 10 контрольных) в амплификаторах с нагреваемой крышкой и позволяет получать фрагменты ДНК длиной от 6 до 15 тысяч пар оснований Состав: Термостабильная ДНК-полимераза (1 е.а./мкл) – 110 мкл Смесь dNTP (2,5 mM каждого) – 450 мкл Смесь контрольных праймеров (P1+P2) (1 μM каждого) – 100 мкл Контрольная матрица (ДНК фага Т7) (4 мкг/мл) – 50 мкл Буфер для реакции (10Х: 250 mM Tris-Tricine (pH 9.2 при 25°C); 850 mM калия ацетат;15 mM магния ацетат; 1 мг/мл желатин; 1% Tween-20; 100 mM 2-меркаптоэтанол; 50% глицерин) – 600 мкл Буфер для разбавления полимеразы (25 mM Tris-HCl (pH 8.0 при 25°C); 50 mM KCl; 0.1 mM EDTA; 0.5 мг/мл желатин; 0.5% Tween-20; 1 mM DTT; 50% глицерин) – 500 мкл Стерильная вода – 3 мл Условия хранения: Хранить при -20°C.

Источник: Выделена из штамма E.coli, несущего рекомбинантный ген Taq-ДНК-полимеразы из Thermus aquaticus.. Описание: Катализирует матричный синтез ДНК путем переноса нуклеотида от dNTP на 3` конец ДНК Определение единицы активности: За одну единицу активности Taq ДНК полимеразы принимали количество фермента,необходимое для включения 10 нмолей dNTP в кислотонерастворимую фракцию за 30 мин при 72°С. Оптимальный буфер: SE-буфер ДНК полимераза Taq (без MgCl2) Условия хранения: 20 mM Tris-HCl (pH 7.6); 100 mM KCl; 0.1 mM EDTA; 1 mM DTT; 0,5 % Тритон Х-100; 50% глицерин. Хранить при -20°С

Описание: Мы предлагаем 10хSE-буферы, оптимизированные для работы с нашими ферментами. 10хSE-буферы обеспечивают оптимальные реакционные условия для достижения 100% активности, производимых нами ферментов (эндонуклеаз рестриции). Каждый фермент поставляется в комплекте с рекомендованным 10хSE-буфером. Некоторые ферменты требуют специфические реакционные условия, поэтому для них созданы индивидуальные кратные SE-буферы. Также некоторым эндонуклеазам рестриции для достижения 100% активности дополнительно требуется бычий сывороточный альбумин (BSA) или S-аденозил-L-метионин (SAM). Когда это необходимо, данные реактивы поставляются в комплекте с ферментом и 10хSE-буфером. Состав: 1X(50 mM Tris-HCl (pH 7.6 при 25°C); 10 mM MgCl2; 100 mM NaCl; 1 mM DTT; 100 μg/ml BSA.) Условия хранения: Хранить при -20°C. Допускается хранение буфера при 4-10°C в течение 3 месяцев. Примечание: Буфер поставляется в концентрации 10Х. В нем присутствует концентрированный BSA, поэтому этот буфер требует бережной разморозки. Мы рекомендуем размораживать SE-буфер O+ (10Х) при комнатной температуре и аккуратно перемешать его перед использованием. В случае нагревания концентрированного буфера до температуры, превышающей 37°C, может образовываться осадок вследствие частичной денатурации BSA.

Сайт узнавания и позиция гидролиза: GAATTC G↑AATTC CTTAAG CTTAA↓G Источник: Из штамма E.coli несущего клонированный ген EcoR I из Escherichia coli Определение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда за 1 час при 37°С в 50 мкл реакционной смеси. Субстрат для определения активности: ДНК фага лямбда Оптимальный буфер: SE-буфер EcoRI Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 50 75 75 75 50 50 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 200 mM NaCl; 0.1 mM EDTA; 7 mM 2-меркаптоэтанол; 200 μg/ml BSA; 50% глицерин; Хранить при -20°С. Лигирование: После гидролиза 40-кратным избытком фермента более 90% фрагментов ДНК сшиваются ДНК-лигазой и могут быть повторно расщеплены. Неспецифический гидролиз: Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 40 ед фермента в течение 16 часов при 37°С. Чувствительность к метилированию: не проверялось С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер EcoRI, BSA (кроме E057T и E058T). Для фасовок Turbo (E057T и E058T) прикладывается только буфер ROSE. Примечание: При большом избытке фермента, при использовании неоптимального буфера возможно появление звездчатой активности. Длительная инкубация c BSA не рекомендуется из-за появления звездчатой активности. Для достижения 100% активности BSA следует добавлять в реакционную смесь до концентрации 100 мкг/мл. BSA при длительной инкубации использовать не рекомендуется.

Сайт узнавания и позиция гидролиза: CGRYCG CGRY↑CG GCYRGC GC↓YRGC Источник: Bacillus stearothermophilus MC Определение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда за 1 час при 50°С в 50 мкл реакционной смеси. Субстрат для определения активности: ДНК фага лямбда Оптимальный буфер: SE-буфер B Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 100 75 10 10 50 100 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 200 mM KCl; 0.1 mM EDTA; 7 mM 2-меркаптоэтанол; 200 ug/ml BSA; 50% глицерин. Хранить при -20°C. Лигирование: После гидролиза 5-кратным избытком фермента более 90% фрагментов ДНК сшиваются ДНК-лигазой и могут быть повторно расщеплены. Неспецифический гидролиз: Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 10 ед фермента в течение 16 часов при 50°C. Чувствительность к метилированию: не проверялось С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер B, BSA Примечание: Для достижения 100% активности BSA следует добавлять в реакционную смесь до концентрации 100 мкг/мл. BSA при длительной инкубации использовать не рекомендуется.

Источник: Выделена из бактериофага Лямбда cI857S7 который был индуцирован температурой из лизогенного штамма E.coli у которого отсутствуют системы метилирования Dam, Dcm Описание: Двухцепочечная линейная ДНК длиной 48502 пары оснований. Молекулярный вес – 31.5х106 дальтон Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.8); 1 mM EDTA. Хранить при – 20°С.