Биореактивы

Сайт узнавания и позиция гидролиза: CTCGAG C↑TCGAG GAGCTC GAGCT↓C Источник: Streptomyces fradiae 274 Определение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда (HindIII-digest) за 1 час при 50°С в 50 мкл реакционной смеси. Субстрат для определения активности: ДНК фага лямбда (Hind III-digest) Оптимальный буфер: SE-буфер B Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 100 75 50 50 75 100 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 50 mM KCl; 0.1 mM EDTA; 200 ug/ml BSA; 7 mM 2-меркаптоэтанол; 50% глицерин. Хранить при -20°С. Лигирование: После гидролиза 20-кратным избытком фермента 90% фрагментов ДНК сшиваются ДНК-лигазой и могут быть повторно расщеплены. Неспецифический гидролиз: Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 40 ед фермента в течение 16 часов при 50°С. Чувствительность к метилированию: Блокируется метилированием CTCGmAG, Не блокируется метилированием CTmCGAG. С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер B. Для фасовок Turbo (E125T и E126T) прикладывается только буфер ROSE. Примечание: При 37°С активность 70% от максимальной.

Азидопропанол - бифункциональный синтон с азидогруппой и гидроксильной группой. Он может использоваться для реакции азид-алкинового диполярного циклоприсоединения или лигирования по Штаудингеру. Гидроксильная группа может быть вовлечена в реакцию с N,N-карбонилдиимидазолом в неводной среде с последующей реакцией с аминами, ведущей к карбаматам. Существует много других способов использования этого линкера.

IntactRNA — нетоксичный водный фиксатор, предназначенный для быстрой стабилизации РНК в образцах ткани и клеток. Предназначен для сбора материала в экспедициях, его транспортировки в незамороженном виде, а также для длительного хранения в замороженном виде. РНК, выделенная из зафиксированных фрагментов ткани, может быть использована для синтеза кДНК и анализа экспрессии генов методом ОТ-ПЦР, пробоподготовки для NGS, Нозерн-блота, трансляции in vitro и других молекулярно-биологических приложений.

Сайт узнавания и позиция гидролиза: TGATCA T↑GATCA ACTAGT ACTAG↓T Источник: Kurthia species 22 Определение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда за 1 час при 37°С в 50 мкл реакционной смеси. Субстрат для определения активности: ДНК фага лямбда Оптимальный буфер: SE-буфер 2K Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 50 75 50 50 25 100 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 250 mM NaCl; 0.1 mM EDTA; 200 ug/ml BSA, 7 mM 2-меркаптоэтанол; 50% глицерин; Хранить при -20°С. Лигирование: После гидролиза 20-кратным избытком фермента более 90% фрагментов ДНК сшиваются ДНК-лигазой и могут быть повторно расщеплены. Неспецифический гидролиз: Картина специфического гиролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 40 ед фермента в течение 16 часов при 37°С. Чувствительность к метилированию: Блокируется при перекрывании Dam-метилированием (GmATC): TGATCA. С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер 2K, BSA. Примечание: Для достижения 100% активности BSA следует добавлять в реакционную смесь до концентрации 100 мкг/мл. BSA при длительной инкубации использовать не рекомендуется.

Сайт узнавания и позиция гидролиза: GCAGC(N)8 GCAGC(N)8↑ CGTCG(N)12 CGTCG(N)12↓ Источник: Bacillus stearothermophilus V1 Определение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК pBR322 за 1 час при 55°С в 50 мкл реакционной смеси. Субстрат для определения активности: ДНК pBR322 Оптимальный буфер: SE-буфер G Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 75 100 75 75 75 100 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 200 mM NaCl; 0.1 mM EDTA; 1 mM 2-меркаптоэтанол; 50% глицерин. Хранить при -20°С. Лигирование: После гидролиза 3-кратным избытком фермента более 90% фрагментов ДНК сшиваются ДНК-лигазой и могут быть повторно расщеплены Неспецифический гидролиз: Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 2 ед фермента в течение 16 часов при 55°С Чувствительность к метилированию: не проверялось С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер G. Примечание: При 37°С активность 10% от максимальной.

Окрашенная реакционная смесь 5X ScreenMix-HS (UDG) предназначена для проведения ПЦР с последующим электрофоретическим анализом продукта в агарозном геле. В состав смеси входят UDG (урацил-ДНКгликозилаза) и нуклеотиды dUTP. На первом этапе фермент UDG разрушает все ранее амплифицированные ПЦР-продукты по включенным остаткам dUTP, что предотвращает кросс-контаминацию. В состав 5X ScreenMix-HS (UDG) входят все необходимые компоненты ПЦР: Taq ДНК-полимераза с «горячим стартом», UDG, смесь dNTP (включая dUTP в оптимальной пропорции), ионы Mg2+, ПЦР буфер, глицерин, красители (красный и желтый). Красители и глицерин позволяют после прохождения ПЦР напрямую наносить реакционную смесь на гель для проведения электрофореза. Для постановки реакции ПЦР в смесь требуется добавить только праймеры, ДНК-матрицу и воду.

Пирен - это один из простейших полиароматических углеводородов (ПАУ). Некоторые производные пирена известны способностью к интеркаляции с ДНК. Производные пирена флуоресцируют. Когда два остатка сирена сближены в пространстве, с помощью метода флуоресцентной спектроскопии можно наблюдать образование эксимеров - возбужденных димеров. Поэтому пирен можно использовать для получения информации о структуре биомолекул. Молекула этинилпирена содержит концевую тройную связь, способную вступать в реакцию Cu(I)-катализируемого диполярного циклоприсоединения, а также в Pd(0)-катализируемую реакцию Соногаширы.

Носитель для синтеза ДНК/РНК — стекло контролируемой пористости для синтеза 3’-модифицированных олигонуклеотидов. Подходит для синтеза олигонуклеотидов длиной до 100 мер. Модификация совместима со стандартными условиями деблокирования олигонуклеотидов — аммиаком, смесью аммиак-метиламин и другими основными реагентами.

Сайт узнавания и позиция гидролиза: GAAGA(N)8 GAAGA(N)8↑ CTTCT(N)7 CTTCT(N)7↓ Источник: Из штамма E.coli несущего клонированный ген Mbo II из Moraxella bovis Определение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда (dam-) за 1 час при 37°С в 50 мкл реакционной смеси. Субстрат для определения активности: ДНК фага лямбда (dam-) Оптимальный буфер: SE-буфер Y Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 75 75 25 50 100 50 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 50 mM NaCl; 0,1 mM EDTA; 1 mM DTT; 200 μg/ml BSA; 50% глицерин; Хранить при -20°С. Лигирование: После гидролиза 5-кратным избытком фермента около 60% фрагментов ДНК сшиваются ДНК-лигазой и могут быть повторно расщеплены. Сшивка более эффективна в присутствии 10% ПЭГ. Неспецифический гидролиз: Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 5 ед фермента в течение 16 часов при 37°С. Чувствительность к метилированию: Блокируется при перекрывании dam-метилированием (GmATC): GAAGATC. С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер Y.

Сайт узнавания и позиция гидролиза: (N)8AAGNNNNNCTT(N)13 ↑(N)8AAGNNNNNCTT(N)13↑ (N)13TTCNNNNNGAA(N)8 ↓(N)13TTCNNNNNGAA(N)8↓ Источник: Flavobacterium aquatile Ob10 Определение единицы активности: За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда за 1 час при 37°С в 50 мкл реакционной смеси. Субстрат для определения активности: ДНК фага лямбда Оптимальный буфер: SE-буфер W + SAM Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной: B G O W Y ROSE 25 75 100 50 70 Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 250 mM NaCl; 0,1 mM EDTA; 200 ug/ml BSA; 7 mM 2-меркаптоэтанол; 50% глицерин; Хранить при -20°С. Лигирование: После гидролиза 3-кратным избытком фермента 20% фрагментов ДНК сшиваются ДНК-лигазой и 80% из них могут быть повторно расщеплены. В присутствии 10% ПЭГ сшивка проходит лучше Неспецифический гидролиз: Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 5 ед фермента в течение 16 часов при 37°С Чувствительность к метилированию: не проверялось С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер W, SAM. Примечание: Большой избыток фермента приводит к появлению звездчатой активности. Для достижения 100% активности SAM следует добавлять в реакционную смесь до концентрации 0.01 mM.

Маркер длин ДНК 100+ bp — стандарт для определения длины двухцепочечных молекул ДНК в диапазоне от 100 до 1500 п.о. в агарозном геле. «DNA Ladder 100+ bp» может быть использован для приблизительной оценки массы фрагмента ДНК в образце путем сравнения интенсивности полос одинаковой длины. «4Х Gel Loading Dye, Blue» предназначен для нанесения маркера длин и исследуемых образцов на гель.

3-Малеимидпропионовой кислоты NHS-эфир представляет собой проникающий сквозь мембраны, нерасщепляемый бифункциональный сшивающий агент. Он содержит гидроксисукцинимидную (NHS) для реакции с аминами, и малеимидную группы для реакции с тиоловыми группами. Благодаря NHS-группе линкер может быть присоединен практически к любой первичной или вторичной аминной группе белков, пептидов или низкомолекулярных аминов. Малеимидный фрагмент обеспечивает легкое присоединение к белкам и пептидам через SH-остатки цистеина, а также к другим тиолированным молекулам, таким как тиолсодержащие олигонуклеотиды. Реагент также используется для синтеза in situ химически нестабильного азида-ПЭГ4-малеимида.