Биореактивы

DusQ 1 dT фосфорамидит — это реагент для синтеза модифицированных олигонуклеотидов, содержащих нефлуоресцирующий тушитель, обычно применяется для мечения по внутреннему положению ДНК зонда. DusQ 1 эффективно гасит флуоресценцию с резонансным переносом энергии (FRET), в статическом варианте — с тушением флуоресценции флуорофора через образование комплекса в основном состоянии, и обычно служит для приготовления зондов для количественной ПЦР с репортером и тушителем. Данный фосфорамидит имеет DMT-защиту гидроксиметильной группы, и может использоваться для очистки на картридже. DusQ 1 может сочетаться с флуорофорами, испускающими в зелёной и жёлтой областях спектра с целью формирования комплексов с высокой эффективностью тушения. Для DusQ 1 характерен широкий спектр поглощения с максимумом в диапазоне 480–580 нм в сочетании с распространенными репортерами, такими как FAM, TET, JOE, HEX, Cyanine3.

Активированный N-гидроксисукцинимидный (NHS) эфир красителя HEX (гексахлорфлуоресцеина), чистый 6-изомер. Активированные эфиры обладают реакционной способностью в отношении первичных и вторичных аминогрупп. С их помощью можно метить аминогруппы в белках, пептидах, амино-модифицированных олигонуклеотидах и других целевых молекулах. HEX — производное флуоресцеина, содержащее в своей структуре 6 атомов хлора в качестве заместителей. HEX является аналогом таких красителей, как JOE, BODIPY™ 530/550, VIC™ по спектральным характеристикам с поглощением при 533 нм и эмиссией при 549 нм в желто-зеленой области спектра. HEX NHS-эфир часто используется в секвенировании нуклеиновых кислот, ПЦР/кПЦР и других схожих исследованиях.

sulfo-Cyanine5.5 (аналог Cy5.5® и Sulfo-Cy5.5®) - водорастворимый флуорофор, излучающий в дальней красной области спектра. Имеет в составе четыре сульфогруппы и благодаря этому при нейтральных pH заряжен отрицательно. Очень гидрофилен. sulfo-Cyanine5.5 демонстрирует очень низкую зависимость флуоресценции от pH, отличается высоким коэффициентом экстинкции. Данный продукт представляет собой карбоксил-производное красителя и может использоваться для калибровки приборов и как нереакционноспособный флуорофор для контроля.

PreciseGreen — ДНК-связывающий краситель на основе бензотиазола. 200-кратный раствор в ДМСО. Это флуоресцентный сенсор, специфичный в отношении двухцепочечной ДНК. Его эмиссию в канале флуоресцеина можно легко детектировать и измерять с помощью кюветного флуориметра, флуориметра для микропланшетов, и с помощью специальных устройств для измерения количества ДНК. PreciseGreen примечателен тем, что флуоресцентный сигнал прямо пропорционален концентрации ДНК в диапазоне от десятков пикограмм до сотен нанограмм в миллилитре образца. Также доступен готовый набор с данным красителем.

Алкин-ПЭГ3-OH (моно-пропаргил-триэтиленгликоль) - бифункциональный линкер, содержащий гидроксигруппу и терминальную тройную связь. Этот линкер можно использовать для модификации различных молекул и введения в их состав алкинильного фрагмента, и последующей конъюгации с помощью Click chemistry.

Азид-ПЭГ2-амин — бифункциональный кросслинкер с терминальными азидо- и аминогруппой. Аминогруппа реагента может быть конъюгирована с карбоксильной группой в составе пептидов, белков или антител после активации последней карбидиимидом (EDC). В свою очередь, терминальная азидная группа легко взаимодействует с различными алкинами в клик-реакциях. Диэтиленгликоль (ПЭГ2) представляет собой короткий гидрофильный линкер с минимальным пространственным разделением биомолекул в составе получаемого конъюгата.

Иммуноглобулины IgY курицы, очищенный белок.

sulfo-Cyanine5 dUTP - модифицированный трифосфат для ферментативного мечения ДНК, аналог Cy5-dUTP. В отличие от трифосфатов, содержащих краситель, напрямую связанный с аминоаллил-dUTP, этот трифосфат содержит линкер, повышающий эффективность его встраивания обычными полимеразами типа Taq-полимеразы. sulfo-Cyanine5 - яркий краситель для дальней красной области (канал Cy5). Трифосфат поставляется в виде лиофилизированной литиевой соли.

Каталитический буфер предназначен для конъюгации белков, модифицированных азидом (или алкином), с алкином (или азидом) красителя с помощью медь-катализируемой реакции 1,3-диполярного циклоприсоединения (CuAAC). THPTA лиганд в составе буфера ускоряет реакцию и стабилизирует каталитически активные соединения меди (I). Кроме того, присутствие водорастворимого THPTA лиганда позволяет проводить реакцию мечения белков в водной среде и, за счёт стабилизации степени окисления (I) меди, минимизирует генерацию активных форм кислорода (АФК) и нежелательное повреждение ими белков. Входящий в состав буфера аминогуанидин препятствуют связыванию реакционноспособных альдегидов - продуктов гидролиза дегидроаскорбата, с боковыми цепями аргинина, N-концевого цистеина и лизина. Готовый 1.5х буфер содержит все необходимые компоненты для проведения реакции, кроме восстановителя меди (II) до меди (I). В качестве восстановителя мы рекомендуем использовать аскорбиновую кислоту. Состав буфера: медь (II), ацетат триэтиламмония pH 6.8, THPTA лиганд, аминогуанидин.

Родамин 6G (R6G) - ксантеновый краситель родаминового ряда. Эмиссия R6G смещена в красную область по сравнению с флуоресцеином. Он, как и флуоресцеин, обладает высоким квантовым выходом эмиссии. Это производное R6G содержит терминальный алкиновый фрагмент для конъюгации с азидами в присутствии катализаторов на основе меди (I).

Талидомид-содержащий билдинг-блок с PEG2-линкером и азидной группой для конъюгации с алкин-функционализированными линкерами и лигандами целевых белков посредством клик-химических реакций. Комбинированные молекулы выборочного протеолиза белка (PROteolysis TArgeting Chimeras, PROTACs) — это гетеробифункциональные молекулы, способные проникать через клеточную мембрану, и позволяющие удалять выбранный целевой белок из клетки. Один конец молекулы PROTAC содержит лиганд, способный связываться с белком интереса, а второй — с субтрат-распознающим белком белкового комплекса E3-лигазы. Сближение белка и E3-лигазы вызывает полиубиквитинирование субстрата с последующей его деградацией клеточной протеасомой, которая распознает убиквитиновую метку. Существует несколько Е3-лигазных комплексов, которые на практике подходят для PROTAC. Талидомид — лиганд, который позволяет мобилизовать цереблон E3-лигазу (CRBN). Его используют многие новые исследовательские препараты работающие по механизму PROTAC, находящиеся на последних стадиях клинических испытаний.

Cyanine3B — цианиновый краситель с желтой эмиссией, являющийся улучшенной версией флуорофора Cyanine3, обладающий значительно более высокими квантовым выходом флуоресценции и фотостабильностью. Cyanine3B карбоновая кислота — это форма Cyanine3B, которую можно использовать в качестве референсного стандарта в экспериментах, где используются конъюгаты данного флуорофора. Cyanine3B карбоновую кислоту также можно использовать для синтеза активированных сложных эфиров, или модифицировать гидразинами, гидроксиламинами и аминами для последующей конъюгации с биомолекулами.