Сайт узнавания и позиция гидролиза:
(N)8AAGNNNNNCTT(N)13 ↑(N)8AAGNNNNNCTT(N)13↑
(N)13TTCNNNNNGAA(N)8 ↓(N)13TTCNNNNNGAA(N)8↓
Источник: Flavobacterium aquatile Ob10
Определение единицы активности:
За единицу активности принимается количество фермента, необходимое для гидролиза 1 мкг ДНК фага лямбда за 1 час при 37°С в 50 мкл реакционной смеси.
Субстрат для определения активности: ДНК фага лямбда
Оптимальный буфер: SE-буфер W + SAM
Активность фермента в различных буферах в процентах от максимальной:
B G O W Y ROSE
25 75 100 50 70
Условия хранения: 10 mM Tris-HCl (pH 7.5); 250 mM NaCl; 0,1 mM EDTA; 200 ug/ml BSA; 7 mM 2-меркаптоэтанол; 50% глицерин; Хранить при -20°С.
Лигирование:
После гидролиза 3-кратным избытком фермента 20% фрагментов ДНК сшиваются ДНК-лигазой и 80% из них могут быть повторно расщеплены. В присутствии 10% ПЭГ сшивка проходит лучше
Неспецифический гидролиз:
Картина специфического гидролиза не изменяется при обработке 1 мкг ДНК 5 ед фермента в течение 16 часов при 37°С
Чувствительность к метилированию: не проверялось
С ферментом поставляется: 10 Х SE-буфер W, SAM.
Примечание:
Большой избыток фермента приводит к появлению звездчатой активности.
Для достижения 100% активности SAM следует добавлять в реакционную смесь до концентрации 0.01 mM.