Cyanine3 — это флуорофор, широко используемый в молекулярно-биологических экспериментах, в том числе для мечения олигонуклеотидов и их последующей детекции. Cyanine3 имеет, с максимум флуоресценции 570 нм, в желтой области спектра.
Cyanine3 фосфорамидит 5′ используется в олигонуклеотидном синтезе для получения меченых Cyanine3 олигонуклеотидов на 5’-конце. Реагент совместим с различными олигонуклеотидными синтезаторами.
Данный фосфорамидит может применяться для синтеза флуоресцентно-меченых праймеров, гибридизационных зондов типа TaqMan и Molecular Beacon. Такие меченые зонды могут детектироваться в мультиплексной ПЦР в реальном времени в канале TAMRA.