AF 488 — яркий, стабильный краситель, пик флуоресценции которого находится в зеленой области спектра — 519 нм. Флуоресценция устойчива в широком диапазоне pH — от 4 до 10.
Конъюгаты биомолекул с AF 488 используются в проточной цитометрии и при изучении клеток микроскопическими методами, в частности, в задачах с многоцветным окрашиванием.
AF 488 амин обладает хорошей растворимостью в воде. Он может быть конъюгирован с электрофилами и участвовать в реакциях ферментативного трансаминирования.