سنتز اولیگونوکلئوتیدها بر روی یک سنتزایزر خودکار DNA خارجی مدرن با استفاده از روش آمیدوفوسفیت انجام می شود. تکنولوژی سنتز امکان به دست آوردن هر مقدار از الیگونوکلئوتیدهای اصلاح شده و اصلاح نشده را فراهم می کند.
هر اولیگونوکلئوتید با توجه به توالی نوکلئوتید با توجه به ترتیب تولید می شود و به روش لازم تصفیه می شود.
شکل تحویل الیگونوکلئوتیدها: به شکل محلول غلظت داده شده یا به شکل یخ زده خشک شده.
گذرنامه الیگونوکلئوتیدها شامل تمام اطلاعات لازم است.